Les missions de veille et d'alerte sanitaire visent à détecter le plus précisément possible tout événement anormal présentant un risque potentiel pour la santé de groupes de population,  essentiellement dans les domaines des maladies transmissibles et de l'exposition à des agents toxiques environnementaux.  Pour cela, un système d'alerte est constitué afin de permettre une réponse rapide,  sous forme d'actions destinées à préserver la santé des groupes des populations concernées.